区别大概就是水性马克笔：墨水没有酒精水性颜色会更接近水彩笔的感觉，颜色丰富度没有酒精性马克笔那么多，颜色之间可以有很自然的过渡，不适合叠加容易变灰，加水可以画出类似水彩的效果。
酒精性马克笔：墨水容易挥发，快干，多用于设计与动漫绘画，颜色会比水性来得通透，比较适合来回叠加不断加深颜色也不会伤纸，颜色也是马克笔里面最丰富的(法三480色)，而且也有补充液(部分)油性马克笔：墨水容易挥发，常用于海报设计，同酒精马克笔一样快干、耐水、而且耐光性比较好，多次叠加颜色不会伤纸，也有补充液。题主的要求不够明确，没有提到自己是画动漫的还是设计的，也没有说到自己的预算是在什么价位，比较难给出一个适合的答案。
而不管是动漫还是设计都比较推荐使用酒精性马克笔来绘制，而水性马克笔不太推荐入门，因为用起来效果一开始没有酒精性马克笔那么好掌握，而中国马克笔第一人也明确告诉了我们水性马克笔可以达到什么程度。设计推荐德系imark马克笔、AD马克笔、温莎牛顿、美辉、touch、法卡勒一代(有补充液)、千彩乐(有补充液)、sta3203、凡迪、遵爵动漫推荐copic(有补充液)、灵猫、温莎牛顿、美辉软头、touch软头、法卡勒三代(有补充液)、千彩乐软头(有补充液)、sta 3203BR如果是入门的话是比较推荐用性价比比较高的国产马克笔：法卡勒、千彩乐、sta、遵爵，其中法卡勒千彩乐是有补充液可以补充的，如果预算不够的话也可以考虑秀普、touchmark等系列。
随后再慢慢的购买一些比较贵的马克笔随着技术不断进阶也挺好的。个人比较推荐法卡勒三代(目前正在用)最后放几张中国马克笔第一人——夏克梁老师的作品(转自夏克梁老师的微博)温莎牛顿色素马克笔绘制由水性马克笔绘制由sta丙烯马克笔与水性马克笔共同绘制
马克笔的区别 扩展
马克笔分为油性马克笔和水性马克笔。首先，两者的效果不同，油性马克笔色彩柔和挥发快，干后颜色会变淡，而水性马克笔颜色鲜艳，笔触清晰，但是干了之后不易变色，稳固性非常好；
第二适用画纸不同，油性马克笔是用于描图纸或者硫酸纸，而水性马克笔通常适合较紧密的卡纸或铜版纸，用来画人物画比较好。
